長期發展策略，交通部參循國家發展政策與運輸政策白皮書，定期執行內外部環境及重要趨勢分析，公告「商港整體發展規劃」，針對我國商港之發展課題，提出具體之發展目標、策略方向及中長期策略（五大面向），並作為港務公司研擬各商港定位與建設計畫之基礎。
我國港口發展課題
- 國際供應鏈變革影響貨量 成長幅度之港群分工策略
- 港口發展新議題（國際經貿 變革、智慧、能源）之因應
政治
- 從多邊主義走向保護主義，影響各國貿易自由度
- 中美貿易戰、日韓貿易戰等，影響全球供應鏈布局結構
新興港口威脅
- 東南亞港口崛起，持續強化營運能力，有機會發展出直航模式，將影響我國轉口貨量
經濟
- 全球經濟發展趨緩，GDP對貨量成長的帶動幅度降低
- 新冠肺炎疫情對全球之衝擊
- 全球供應鏈增加東南亞地區部署
貨源壓力
- 進出口貨量將持續穩定成長，但成長幅趨緩
- 轉口貨量持平發展，區域內航線貨量明顯增加及跨太平洋航線運量微幅下降
航商選擇
- 航商聯盟重組，影響港口選擇方式
- 我國以地主港模式經營，在有國籍航商進駐的條件下鞏固貨量，但尚無法吸引外籍業者加入經營
技術
- 各大商港持續運用科技技術提升港口服務效率，提升管理品質
- 新通訊技術之開發與應用
既有競爭港威脅
- 周邊港口如廈門港、鹽田港等貨量大幅成長，且航線佈局較廣與我國競爭轉口貨源
社會環境
- 對環保議題之重視
- LNG加注與接收站設置需求
- 離岸風電發展需求
- 人口下降問題
- 觀光市場發展前景
國際商港
目標：強化智慧創新與多元服務，鞏固海運樞紐地位
五大發展目標：
（一）貨運發展
- 因應市場變革調整各港貨運發展定位，港群共同對外發展
- 調配各類碼頭作業能量與使用機能，強化港區資源使用效率
- 增加集貨誘因，強化轉口競爭力
- 提升加值服務內涵，持續創量增值
- 加強業者合作經營，增加港口服務面
（二）客運發展
- 結合地方觀光資源，吸引國際郵輪來臺
- 協助推動藍色公路政策，發展國內跳島郵輪及渡輪服務
- 拓展港區多元遊憩服務，提升觀光服務品質
（三）環保能源因應
- 因應國家能源政策，彈性調整港口LNG相關設施
- 因應離岸風電產業需求，提供集中配置之發展腹地
- 因應國內外環保公約，推動港口永續相關措施
（四）科技應用
- 規劃智慧化藍圖與試驗場域機制，落實數位轉型
- 建構優質資通訊設施，擴大科技應用範疇以提升安全與效率
- 與利害關係人共同推動數位平臺，強化國際鏈結
（五）組織與經營管理
- 因應市場變化，調整港口發展戰略層級
- 促進航港合作，確保運作效率與財務永續
- 因應港口轉型發展，強化人才培育
- 促進部會合作，共謀港口發展綜效
港務公司已依循上位計畫—商港整體發展規劃（111年-115年），另提出「國際商港未來發展及建設計畫（111年-115年）」之下位計畫，經行政院核定，以「深耕核心，提升港棧營運效能」、「邁向多元，開創新興業務版圖」、「數位轉型，打造科技智慧港口」及「永續發展，擴大企業經營價值」四大主軸推動各項業務，執行港埠建設計畫，積極辦理港口基礎設施之優化與升級，並順應經濟情勢及海運市場變動靈活調整經營策略，促使臺灣港群邁向永續經營發展。